Universal miRNA Cloning Linker (5′腺苷化3′封闭)-产品资讯-资讯-生物在线

Universal miRNA Cloning Linker (5′腺苷化3′封闭)

作者:上海雅吉生物科技有限公司 2020-11-13T11:23 (访问量:3058)

Universal miRNA Cloning Linker (5´腺苷化3´封闭),即通用miRNA克隆接头(5´腺苷化3´封闭)或Universal miRNA Cloning Linker (5'adenylated, 3'blocked),是一种常用于miRNA等3’端为羟基的RNA或3’端为羟基的单链DNA在克隆、高通量测序建库或PCR检测等时,在3’端添加的接头。

本产品5´端腺苷酰化(也称5´端预腺苷酰化或5´端预腺苷化,5′ pre-adenylated或5′ pre-adenylation),3´端氨基封闭,可以用于3’端为羟基的RNA的3’端接头的添加。RNA连接酶可以识别“活化”的5´端腺苷酰化的本产品,在无需ATP存在的条件下,可将本产品的5´端与另外一条单链寡核苷酸的3´端羟基共价连接。利用5´端腺苷酰化,3´端封闭的本产品,加入RNA连接酶,在无需添加ATP的条件下,就能实现本产品5’端和目标序列3’羟基的特异性共价连接。例如和miRNA连接时,可以有效避免miRNA的自连、不同miRNA之间的连接、本产品的自连或本产品不同链之间的连接,而仅发生本产品5’端和miRNA 3’羟基之间的特异性连接。

本产品的电泳图和连接效果图请参考图1。图中可见,本产品条带清晰,纯度高,与5’端为磷酸化的序列相比有显著的电泳迁移率差异(图1A);并且本产品使用T4 RNA ligase 2 (T4 Rnl2), truncated与ssRNA连接时,连接效率非常高(图1B)。

图1. Universal miRNA Cloning Linker Linker (5´腺苷化3´封闭)及其连接效果图图。图A. 本产品5´-rAppCTGTAGGCACCATCAAT–NH2-3´ (AppDNA)与5´-pCTGTAGGCACCATCAAT–NH2-3´ (pDNA)的电泳对比图。图B. 本产品(AppDNA)与ssRNA使用T4 RNA ligase 2 (T4 Rnl2), truncated的连接效果图。图中可见本产品与ssRNA有非常高的连接效率。

本产品的寡核苷酸序列是:5´-rAppCTGTAGGCACCATCAAT–NH2-3´。本产品的序列同NEB公司的S1315S Universal miRNA Cloning Linker。

本产品以水溶液的形式存在,浓度为40ng/µl,即6.9µM。

用途:本产品可以应用于小RNA克隆、miRNA文库构建。

本产品的1µg小包装约通常可以进行8-17次连接反应,5µg中包装约通常可以进行40-85次连接反应。具体的连接反应次数和反应体系的体积和本产品的用量有关。

包装清单:

产品编号 产品名称 包装
R0702S Universal miRNA Cloning Linker (40ng/µl) 1µg
说明书 1份

产品编号 产品名称 包装
R0702M Universal miRNA Cloning Linker (40ng/µl) 5µg
说明书 1份

保存条件:

-20℃保存,一年有效。-80℃保存,至少一年有效。

注意事项:

本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。

为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

使用说明:
1.使用本产品与ssRNA的3’羟基末端连接推荐使用T4 TNA Ligase 2, truncated。也可以使用T4 TNA Ligase 2, truncated,K227Q,或T4 TNA Ligase 2, truncated,T4 TNA Ligase 2, truncatedKQ (R55K, K227Q)。
2.参考下表在冰浴中配制如下反应体系:

Reagent Volume Final Concentration
ssRNA xµl 0.5µM
DEPC-treated Water (1.1 or 2.55)-xµl -
Universal miRNA Cloning Linker (6.9pmol/µl) 2.9 or 1.45µl 1 or 0.5µM
PEG8000 (50%, RNase Free) 12µl 0.3
10X Reaction Buffer 2µl 1 X
RNase Inhibitor (40U/μl) 1µl 2U/μl
T4 RNA Ligase2, truncated (200U/µl) 1µl 10U/µl -
Total Volume 20µl -

注意:
a.由于涉及RNA操作,需要严格按照RNA操作的规范进行,避免RNase污染,相关试剂和耗材需要经过DECP处理去除RNase或者确保是RNase free的。推荐在连接体系中添加RNase Inhibitor,以避免ssRNA或其连接产物的降解,尽管经测试我们发现在严格操作的情况下,不加RNase Inhibitor也不会导致ssRNA或其连接产物发生明显降解。
b.进行连接反应时,如果样品RNA比较珍贵,希望充分被连接,可以按照接头和样品RNA的摩尔比为2:1的比例进行连接;如果样品RNA比较充裕,同时感觉本产品的成本偏高时,可以按照接头和样品RNA的摩尔比摩尔比1:1甚至1:2的比例进行连接反应,这样可以很好地节省本产品。
c.如果同时进行多个连接反应,可以把上表中除ssRNA之外的所有溶液和酶提前预混合,然后再分装到各反应管内。
3.连接反应:25℃, 孵育60min。为了使连接反应更加充分,可以适当延长连接反应时间。
4.终止反应:65℃,孵育15min。

上海雅吉生物科技有限公司 商家主页

地 址: 上海市闵行区元江路5500号第1幢5658室

联系人: 王源

电 话: 15301693058

传 真: 021-34661275

Email:yajikit@163.com

相关咨询

人原代附睾管上皮细胞 (2021-07-08T14:16 浏览数:9636)

雅吉生物热烈庆祝中国建党100周年 (2021-07-02T09:17 浏览数:5257)

15P-1 (小鼠睾丸上皮细胞) (STR鉴定正确) (2021-06-23T09:59 浏览数:7759)

客户细胞培养过程中常见的问题说明 (2021-06-18T09:54 浏览数:9888)

免疫荧光鉴定步骤 (2021-06-18T09:54 浏览数:11388)

人真皮成纤维细胞的分离培养制备方式 (2021-06-17T09:04 浏览数:7933)

原代角质形成细胞的分离培养方法 (2021-06-17T09:03 浏览数:11530)

钻石探头量子显微镜可以探索纳米微观世界的奥秘 (2021-06-16T09:24 浏览数:8533)

过氧化物酶体活化受体可以加剧肿瘤形成 (2021-06-16T09:23 浏览数:8517)

式细胞术数据分析之——圈门技巧 (2021-06-15T10:11 浏览数:8894)

ADVERTISEMENT