2021年底，Omicron（B.1.1.529）突变体的出现对疫苗的有效性提出了很大的挑战，Omicron Spike蛋白具有三十多个突变位点。最近，Omicron突变株的亚系BA.2.12、BA.4和BA.5，表现出更强的免疫逃避能力，并在全球范围内传播。然而，近来又有一种新出现的亚系BA.2.75在印度传播很快，在印度最近报告的序列中占20%以上。与BA.2相比，BA.2.75在Spike有9个突变位点，其中N端结构域(NTD)有5个突变位点，分别为K147E、W152R、F157L、I210V和G257S，受体结合结构域(RBD)有4个突变位点，分别是D339H、G446S、N460K和R493Q。其中，BA.1出现G446S突变，BA.4/BA.5出现R493Q突变。在主流突变株中未观察到N460K和D339H突变，其功能尚不清楚。BA.2.75较BA.2.38和BA.4/BA.5表现出显著的局部增长优势。
图1. Omicron突变亚系BA.1、BA.2、BA.4/5和BA.2.75上的Spike突变位点[1]
Yunlong Cao等研究团队发现BA.2.75比BA.2.12.1对接种后BA.2感染的血浆具有更强的中和作用，但比BA.4/BA.5更弱。然而，在接种后Delta感染的一小份血浆样本中，BA.2.75似乎比BA.4/BA.5更具有更强的免疫逃逸作用，这可能可以解释BA.2.75相对于BA.4/BA.5在印度的增长优势。这种现象可能与Delta的R452刺激有关，它可以产生对BA.4/BA.5(也有R452)非常有效的强效抗体。与BA.2相比，REGN10933和COV2-2196由于R493Q的逆转突变而部分恢复了对BA.2.75的中和作用。然而，它们对应的鸡尾酒的疗效没有显著改变，因为REGN10987和COV2-2130由于G446S突变而表现出降低的中和活性[2]。
图2. BA.2.38和BA.2.75引起的体液免疫逃避[2]
为了研究BA.2.75的抗体逃逸机制，研究者测定了一组对BA.2有效的中和抗体，这些抗体来自D339H、N460K、R493Q和G446S可能影响的5个表位群。与BA.2相比，BA.2.75额外携带的4个RBD突变都可能导致中和逃逸，并且BA.2.75的抗体逃逸机制与BA.4/BA.5不同[2]。
图3. BA.2.75的抗体逃逸机制[2]
通过表面等离子体共振(SPR)测定，BA.2.75的RBD比BA.2的RBD具有更高的hACE-2结合亲和力，以及BA.2.12.1和BA.4/BA.5的RBD。根据深度突变扫描(deep mutational scanning, DMS)结果，应该归因于R493Q和N460K突变，这种增强亲和力的特性正在进一步研究和验证[2]。
图4. BA.2和BA.2.75突变株RBD与ACE-2亲和力验证[2]
近岸蛋白提供Omicron、BA.2、BA.2.12.1、BA.3、BA.4、BA.5以及BA.2.75等多种突变株蛋白、假病毒和ACE-2过表达细胞株，可用于中和抗体/疫苗效价评估等。
部分数据展示：
配体和受体结合
Immobilized Human ACE-2-Fc(Cat#C05Y) at 5μg/ml (100 μl/well)can bind SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.75)-His(Cat#DRA217).The ED50 of SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.75)-His(Cat#DRA217)is 27.52 ng/ml.
抗原和抗体结合
Immobilized Anti-2019-nCoV S1 mAb (5D9) (Cat#NC025) at 5μg/ml (100 μl/well)can bind SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.75)-His(Cat#DRA217).The ED50 of SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.75)-His(Cat#DRA217)is 0.672 ug/ml.
近岸蛋白提供Omicron及亚谱系突变蛋白：
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Cat. No. |
Product Name |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.75, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.3, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.12.1, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.4&BA.5, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S-trimer Protein (BA.4, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S-trimer Protein (Deltacron, BA.1×AY.4 recombinant, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2, C-mFc) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S-trimer Protein (BA.2, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (Omicron, B.1.1.529, C-6His) |
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Biotinylated SARS-CoV-2 S Protein RBD (Omicron, B.1.1.529, C-6His-Avi) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S1 Protein (Omicron, B.1.1.529, C-10His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S-trimer Protein V2 (Omicron, B.1.1.529, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 Nucleocapsid Protein (Omicron, B.1.1.529, N-6His) |
参考文献
1. Evasion of neutralizing antibodies by Omicron sublineage BA.2.75. doi: https://doi.org/10.1101/2022.07.19.500716
2. Neutralizing antibody evasion and receptor binding features of SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75. doi: https://doi.org/10.1101/2022.07.18.500332
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